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靜息態(tài)fMRI、DTI、VBM數(shù)據(jù)處理實(shí)戰(zhàn)學(xué)習(xí)班

發(fā)布時(shí)間:2010-06-09瀏覽數(shù):2863

靜息態(tài)fMRI、DTI、VBM數(shù)據(jù)處理實(shí)戰(zhàn)學(xué)習(xí)班
8月18日- 22日,中國(guó)?深圳

主辦單位:深圳市美德醫(yī)療電子技術(shù)有限公司
聯(lián)合教學(xué)單位:美國(guó)杜克大學(xué)腦成像中心(Duke University)
              北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
             
一、 簡(jiǎn)介
隨著磁共振技術(shù)的迅速發(fā)展,fMRI、DTI及VBM技術(shù)以其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)已越來(lái)越多地應(yīng)用到認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域。自4月份在成都舉辦“靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)處理及臨床研究研討班”以來(lái),我們收到眾多學(xué)員的反饋,希望學(xué)習(xí)更多關(guān)于數(shù)據(jù)處理方面的知識(shí)。為提高相關(guān)科研人員對(duì)磁共振新技術(shù)、新應(yīng)用的認(rèn)識(shí)水平與實(shí)際操作能力,我們特舉辦本次“靜息態(tài)fMRI、DTI、VBM數(shù)據(jù)處理實(shí)戰(zhàn)學(xué)習(xí)班”,邀請(qǐng)國(guó)內(nèi)外相關(guān)領(lǐng)域知名專家和技術(shù)人員授課,分別為大家詳細(xì)講述靜息態(tài)fMRI、DTI、VBM數(shù)據(jù)處理的要點(diǎn)、難點(diǎn)。
1、靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)內(nèi)容
BOLD-fMRI技術(shù)自1990年發(fā)明至今,已經(jīng)成為研究人腦功能的不可替代的手段。但20年來(lái),除了少數(shù)單位將BOLD-fMRI用于協(xié)助腦病變術(shù)前功能定位,基本上未用于臨床實(shí)踐。近幾年來(lái),由于數(shù)據(jù)分析方法的進(jìn)步,靜息態(tài)fMRI正在被越來(lái)越多地用于臨床基礎(chǔ)研究。與PET或SPECT相比較,靜息態(tài)fMRI有較好的時(shí)間分辨率、不需要注射放射性藥物;與EEG相比,靜息態(tài)fMRI有較好的空間分辨率;與任務(wù)狀態(tài)fMRI相比較,靜息態(tài)fMRI簡(jiǎn)單方便、可重復(fù)性好。這些優(yōu)點(diǎn),使得靜息態(tài)fMRI具有較好的臨床應(yīng)用前景。靜息態(tài)fMRI已經(jīng)被用于各種神經(jīng)精神疾病的研究,如癲癇、Parkinson 氏病、Alzheimer氏病、精神分裂癥、抑郁癥、兒童注意缺陷多動(dòng)障礙、創(chuàng)作后應(yīng)激障礙、自閉癥以及腦腫瘤的術(shù)前功能定位等等。
事實(shí)上,所謂靜息態(tài)(resting-state),只是狀態(tài)(states)的一種而已,研究者可以根據(jù)自己的需要,設(shè)計(jì)各種各樣的狀態(tài)(states),比如情緒激發(fā)狀態(tài)、成癮者的渴求狀態(tài)、針灸的“得氣”狀態(tài)等等。這幾種特殊的狀態(tài),往往不適合用傳統(tǒng)的block設(shè)計(jì)或事件相關(guān)設(shè)計(jì)。這種狀態(tài)fMRI(state-fMRI)可以大大拓寬實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的范式。State-fMRI數(shù)據(jù)處理,與傳統(tǒng)的block設(shè)計(jì)或事件相關(guān)設(shè)計(jì)的數(shù)據(jù)處理也有很大不同。除了腦疾病研究,Resting-state-或state-fMRI也正在被越來(lái)越多地用于認(rèn)知科學(xué)的研究以及針灸的研究,甚至被用于神經(jīng)系統(tǒng)之外的研究,如肝、腎、四肢等。
本部分主要內(nèi)容包括:
1) 使用REST DICOM Sorter整理原始數(shù)據(jù)。
2) 使用SPM對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。
3) 使用REST對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行去線性趨勢(shì)、濾波等操作,以及使用REST進(jìn)行Functional Connectivity (FC),Regional Homogeneity (ReHo),Amplitude of Low-Frequency Fluctuation (ALFF)和Fractional ALFF (fALFF)計(jì)算。
4) 使用DPARSF進(jìn)行批處理分析(從DICOM數(shù)據(jù)到預(yù)處理,再到FC,ReHo,ALFF,fALFF結(jié)果)。
5) 使用REST和DPARSF去除協(xié)變量,提取感興趣區(qū)(ROI)或AAL腦區(qū)的時(shí)間序列。
6) 使用SPM和REST(Release 100506新增內(nèi)容)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
7) 使用REST Slice Viewer查看結(jié)果,設(shè)定cluster size,制作ROI mask,保存圖片用于發(fā)表。
8) 多重比較校正:Monte Carlo模擬與Bonferroni、FDR、FWE校正的區(qū)別,以及REST AlphaSim的使用。
9) REST Image Calculator的使用。
10) 其他功能:.nii數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)換,REST讀寫接口的使用。

2、 DTI數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)內(nèi)容
DTI作為一種新型的磁共振技術(shù),是目前最常用的非侵入性研究大腦白質(zhì)結(jié)構(gòu)的技術(shù)手段。利用DTI的各種擴(kuò)散屬性指標(biāo)如FA, ADC值,可以了解大腦白質(zhì)結(jié)構(gòu)的完整性信息;通過(guò)纖維跟蹤技術(shù)可以對(duì)大腦白質(zhì)纖維束進(jìn)行重建和可視化,研究不同腦區(qū)之間的解剖連接和神經(jīng)環(huán)路,從而進(jìn)一步揭示大腦的結(jié)構(gòu)和功能信息。由于其無(wú)創(chuàng)性和基于活體研究的特點(diǎn),DTI已經(jīng)廣泛地應(yīng)用于各種神經(jīng)精神疾病,如精神分裂癥,阿爾茨海默癥,多發(fā)性硬化和抑郁癥等的研究。眾多研究表明神經(jīng)精神疾病都伴隨著腦白質(zhì)的異常變化,這對(duì)于認(rèn)識(shí)疾病的發(fā)病機(jī)理和病變機(jī)制有重要意義。
本部分的培訓(xùn)內(nèi)容主要分為以下幾個(gè)方面:
1) DTI數(shù)據(jù)的預(yù)處理(數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換,圖像質(zhì)量檢查,渦流校正)
2) 利用DTIStudio軟件進(jìn)行各種擴(kuò)散屬性指標(biāo)的解算
3) 利用DTIStudio軟件進(jìn)行纖維跟蹤,可視化,以及定量分析

3、VBM數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)內(nèi)容
VBM (Voxel Based Morphometry)是一種基于體素的針對(duì)腦組織結(jié)構(gòu)的形態(tài)學(xué)測(cè)量方法。它通過(guò)計(jì)算磁共振圖像(主要是高分辨率的結(jié)構(gòu)掃描圖像)中腦的灰質(zhì)/白質(zhì)的變化來(lái)定量分析不同群體腦結(jié)構(gòu)的特征和腦組織成分的差異,從而替代了傳統(tǒng)上人工勾畫感興趣區(qū)域(ROI)的方法,提高了測(cè)量的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性,能夠準(zhǔn)確、全面評(píng)價(jià)不同群體腦的神經(jīng)解剖變化。目前,這種分析方法已經(jīng)廣泛應(yīng)用于精神分裂癥,阿爾茨海默癥,抑郁癥等多種神經(jīng)精神科疾病的研究。
本部分的培訓(xùn)內(nèi)容主要分為以下幾個(gè)方面:
1) VBM基本介紹,包括VBM的基本原理,分析過(guò)程中采用的SPM8的Dartel Tools,New Segment和VBM8-Toolbox的介紹
2) VBM腦結(jié)構(gòu)圖像的預(yù)處理,包括圖像的分割,標(biāo)化和平滑及其相關(guān)的參數(shù)選擇
3) VBM的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析基本流程以及結(jié)果的展示

此次學(xué)習(xí)班面向認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域的研究人員及研究生、神經(jīng)科、精神科和放射科醫(yī)生及相關(guān)醫(yī)務(wù)人員。
在這美麗的海濱城市--深圳,我們熱忱期待您的光臨!

二、 授課專家
 
宋無(wú)名 (Allen W. Song),博士,教授,杜克大學(xué)腦成像中心(Duke University Brain Imaging and Analysis Center)主任。1991年在上海交通大學(xué)獲電機(jī)工程學(xué)學(xué)士學(xué)位,同年赴美入威斯康辛醫(yī)學(xué)院,1995年獲博士學(xué)位。1996年1月在美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生院(NIH)從事博士后研究。1997年1月獲聘為Emory大學(xué)助教授,從事大腦功能磁共振造影研究。1999年4月獲聘于杜克大學(xué)(Duke University)腦成像中心副主任,兼放射系助教授。2001年獲美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)青年教授獎(jiǎng)。2003年升任放射系副教授。2006年升任放射系正教授,終身職,兼任生物醫(yī)學(xué)工程系、精神病學(xué)系及神經(jīng)生物學(xué)系正教授,并擔(dān)任杜克大學(xué)腦成像中心主任,杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院執(zhí)行委員會(huì)常務(wù)成員至今。
宋無(wú)名教授已發(fā)表長(zhǎng)篇論文超過(guò)70篇,短篇論文超過(guò)100篇。他與Scott Huettel及Gregory McCarthy教授在2004年(第一版)和2009年(第二版)合寫的《Functional Magnetic Resonance Imaging》是現(xiàn)在美國(guó)大學(xué)在該領(lǐng)域最權(quán)威最通用的fMRI專業(yè)教科書。他作為課題負(fù)責(zé)人累積聯(lián)邦研究基金約2千萬(wàn)美元。另外,他還是美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)(NSF)和美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生院(NIH)評(píng)審,NeuroImage編委,《美國(guó)科學(xué)院報(bào)》、《生物醫(yī)學(xué)成像》、《醫(yī)學(xué)磁共振》等雜志及國(guó)際磁共振年會(huì)的評(píng)審。


臧玉峰,醫(yī)學(xué)博士,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室教授。主要研究興趣為靜息態(tài)fMRI計(jì)算方法及其在腦疾病的應(yīng)用研究。針對(duì)靜息態(tài)fMRI,提出了兩種計(jì)算方法,分別為“局部一致性” (Zang et al., 2004, NeuroImage)和“低頻振幅”(Zang et al., 2007, Brain Dev)。開發(fā)了針對(duì)靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)處理軟件包REST(宋曉偉等,www.restfmri.net)。與國(guó)內(nèi)外多個(gè)研究單位合作,將靜息態(tài)fMRI用于各種神經(jīng)精神疾病的研究。在靜息態(tài)fMRI領(lǐng)域發(fā)表論文20余篇。


嚴(yán)超贛,男,2006年7月于北京科技大學(xué)獲工學(xué)學(xué)士學(xué)位,2006年9月起于北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室攻讀博士學(xué)位。主要研究方向?yàn)殪o息態(tài)fMRI計(jì)算方法與應(yīng)用,靜息態(tài)默認(rèn)網(wǎng)絡(luò)功能,靜息態(tài)Granger因果關(guān)系分析及復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模式研究。編制了靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)處理助手DPARSF,負(fù)責(zé)了靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)分析工具包REST的升級(jí)與維護(hù),編制了靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)處理多媒體教程。已在Cerebral Cortex, PLoS ONE等國(guó)際主流期刊發(fā)表學(xué)術(shù)論文7篇,其中第一作者3篇。


湯偉軍,男,復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院放射科主治醫(yī)師。1994年畢業(yè)于上海醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)系,1996年獲影像醫(yī)學(xué)與核醫(yī)學(xué)專業(yè)碩士,2002年獲影像醫(yī)學(xué)與核醫(yī)學(xué)專業(yè)博士,師從陳星榮教授。2003.11-2006.3在復(fù)旦大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與工程博士后流動(dòng)站從事腦功能磁共振數(shù)據(jù)處理的研究。目前主要研究方向?yàn)槟X腫瘤患者的功能定位與術(shù)后隨訪,多模態(tài)圖像數(shù)據(jù)的融合及其在神經(jīng)導(dǎo)航手術(shù)中的應(yīng)用。作為子課題負(fù)責(zé)人參與國(guó)家973項(xiàng)目一項(xiàng),參與國(guó)家自然科學(xué)基金2項(xiàng),市級(jí)課題多項(xiàng)。以第一作者或通訊作者發(fā)表論文8篇。


 
舒妮,女,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室講師。2004年畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)自動(dòng)化系;2004-2009年在中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所模式識(shí)別國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室攻讀碩士和博士學(xué)位,博士論文題目為基于擴(kuò)散張量成像的腦解剖網(wǎng)絡(luò)及可塑性研究,導(dǎo)師為 蔣田仔教授;2009年8月進(jìn)入北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室工作。目前主要從事基于擴(kuò)散張量成像的腦解剖網(wǎng)絡(luò)的方法學(xué)及應(yīng)用研究。參與多項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目,在擴(kuò)散張量成像領(lǐng)域取得了一系列的研究成果,一共發(fā)表SCI論文9篇。


3. 課程安排  
詳細(xì)課程安排正在制定中。。。。

備注
? 培訓(xùn)費(fèi)用:每人2500元。包括培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、餐費(fèi);交通及住宿費(fèi)用自理。
? 培訓(xùn)地點(diǎn):招商局培訓(xùn)基地二層A會(huì)議室
? 學(xué)員住宿地點(diǎn):招商局培訓(xùn)基地           標(biāo)準(zhǔn)雙人間:240元/間/天。
? 全體學(xué)員于2010年8月17日下午起在招商局培訓(xùn)基地集中報(bào)到,18-22日全天培訓(xùn)。
? 課程安排以報(bào)到當(dāng)日發(fā)放的課程表為準(zhǔn)
? 此次培訓(xùn)主要以上機(jī)操作為主,所以請(qǐng)學(xué)員務(wù)必自帶筆記本電腦,并按照要求預(yù)安裝相關(guān)軟  
件,我們會(huì)在確認(rèn)報(bào)名后提供安裝指導(dǎo)書和部分?jǐn)?shù)據(jù)。
? 報(bào)名方法:電話、傳真、郵寄、電子郵件均可,最好以電話確認(rèn)。
                    培訓(xùn)班限定60個(gè)名額,以報(bào)名先后為準(zhǔn)。為便于會(huì)務(wù)安排,敬請(qǐng)從速!
                    報(bào)名截止日期:2010年8月8日
 
    報(bào)名聯(lián)系人:王蘭 
聯(lián)系電話:0755-26861119  
傳真:0755-26862769  13823635341
     Email:wanglan@sinorad.com

乘車路線圖:
? 培訓(xùn)地址:深圳市南山區(qū),蛇口育才路八號(hào),招商局培訓(xùn)基地  
聯(lián)系人:董先生      聯(lián)系電話:0755-26811288  13480873066
? 乘車路線:火車站乘K204或204大巴至招商大廈下;飛機(jī)場(chǎng)乘355大巴至招商大廈下。

 

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